“神日本磐余彦尊”为和式的谥号，“神武”则是汉式的谥号，和谥为故有谥号，汉谥则为后世所追赠 。至少《古事记》纂成之时，尚未出现汉风谥号 。据《释日本纪》表示，神武帝以下古代天皇之谥号，为弘文天皇的曾孙淡海三船于天平宝字6年（762年）～天平宝字8年（764年，奈良时代后期）所追赠 。
此外，“若御毛沼命”之名带有五榖神的意义，而橿原乃至大和一带自古便是重要的谷仓，且此处关于磐余彦的传说也十分之多 。很有可能这些故事混合在一起，便构成神武这传奇性的开国天皇 。另一说由禅师中岩圆月提出，说是吴太伯或其后人 。
另外，有人猜测神武天皇是秦朝时被秦始皇派遣寻找长生不老药的方士徐福 。但这种猜测漏洞很大，神武天皇诞生是公元前711年，立国为公元前660年 。而徐褔则是在公元前219年上书，前210年还未出海，神武天皇诞生以现时资料比较上比徐褔早了五百余年 。即使去除阙史八代缺少事迹的天皇，之后继位的崇神天皇即位较徐福上书也晚了一百多年 。
在考古研究中，又有提出神武即是崇神天皇的讹传 。当然，如果不考究故事的可信度，我们可以将东征的故事看成大和政权由九州向东推至大和的过程缩影 。明治之后，由于皇权大兴，对神武事迹的时间考证也逐渐热络：那柯通世提出以前660年为开国之年的说法，之后而衍伸出纪元节这种开国之日 。此外，1889年日本政府在据说他建国地的奈良县橿原市重建橿原神宫 。
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