随着医学技术的飞速发展，人类对于医学其人文性的思考越来越多，对于生命的思考也越来越深刻，这为医学人文的诞生提供了十分重要的理论基础；随着医学工作者整体综合素质的不断提高，医学工作者对于工作的思考与总结也日益增多，其质量也日益提高，这为医学人文的诞生提供了很重要的学术基础 。
医学人文的发展：
自二十世纪七十年代以后，随着医学模式从生物医学模式向“生理-心理-社会”医学模式转变，以及关于医学的“目的和价值”问题的探讨成为热点，我国医学人文学的教学与研究便出现了热潮，一些医学院校陆续开始了医学人文学的教学，一些医学人文学方面的著作也相继问世 。
从无到有，从小到大，我国医学人文学在这一热潮中得到了长足发展 。 然而这一时期我国医学人文学的发展还存在许多缺憾，诸如其发展多为孤立的、单向度的，缺乏学科间的交流与融合，没有形成与医学相匹配的医学人文学学科群 。
截至2012年12月，北医拥有1个国家重点实验室，1个国家工程实验室，29个省部级重点实验室和研究中心 。 成立了糖尿病研究中心、医学遗传学中心、衰老研究中心、感染病研究中心、系统生物医学研究所、临床研究所、医学信息学中心、中国卫生发展研究中心等研究机构 。
国家重点实验室：天然药物及仿生药物国家重点实验室
国家工程实验室：口腔数字化医疗技术和材料国家工程实验室
教育部重点实验室：分子心血管学教育部重点实验室、神经科学教育部重点实验室、恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室、视觉损伤与修复教育部重点实验室、慢性肾脏病防治教育部重点实验室、辅助生殖教育部重点实验室
教育部工程研究中心：再生医学教育部工程研究中心
卫生部重点实验室：卫生部精神卫生学重点实验室、卫生部神经科学重点实验室、卫生部肾脏疾病重点实验室、卫生部医学免疫重点实验室、卫生部心血管分子生物学与调节肽重点实验室、卫生部生育健康重点实验室
卫生部工程研究中心：卫生部口腔医学计算机应用工程技术研究中心
北京市重点实验室：皮肤病分子诊断北京市重点实验室、造血干细胞移植治疗血液病研究北京市重点实验室、丙型肝炎和肝病免疫治疗北京市重点实验室、脊柱疾病研究北京市重点实验室、生殖内分泌与辅助生殖技术北京市重点实验室、磁共振成像设备与技术北京市重点实验室、恶性肿瘤转化研究北京市重点实验室、食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室、蛋白质修饰与细胞功能北京市重点实验室、儿科遗传性疾病分子诊断与研究北京市重点实验室、肝硬化肝癌外科基础研究北京市重点实验室、骨与软组织肿瘤诊治研究北京市重点实验室、痴呆诊治转化医学研究北京市重点实验室等 2014年度，医学部共获批973/重大科学研究、863计划、科技支撑、卫生公益性行业专项等国家科技计划项目（课题）28项，经费1.25亿元 。 其中，张强牵头的重大科学研究项目获滚动支持，张强获聘重大科学研究计划项目首席科学家；陆林获聘973计划项目首席科学家 。 李立明牵头的卫生公益性行业专项获得滚动支持 。 陶勇获得医学部在863计划领域第一个青年科学家专题项目 。
2014年度获批国家自然科学基金303项，批准经费1.9亿元 。 其中，第一医院杨勇、陈旻，口腔医院邓旭亮获国家杰出青年科学基金资助；第三医院王乐今申报的国家重大科研仪器研制项目“植入式青光眼眼压监测与微引流智能仪器的研究”获准立项，批准经费710万元 。
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