新冠病毒基因组演化分析有重要进展


新冠病毒基因组演化分析有重要进展



采访人员从中国科学院昆明动物研究所获悉, 该所与国内多家研究机构合作, 解析了新型冠状病毒基因组的演化规律, 提出了具有层次结构的谱系、亚谱系划分系统 。 《科学通报》期刊发表了这一重要成果 。
随着感染人数增加, 新冠病毒会快速发展出许多不同的株系 。 人类急需对这些新出现的变异进行梳理与描述, 并更加精细化地展示新冠病毒在人群中的演变轨迹 。
中科院昆明动物研究所吕雪梅、张亚平课题组与北京大学生命科学学院陆剑课题组、中国疾病预防控制中心谭文杰课题组等团队合作, 分析了121618个高质量病毒基因组中的单核苷酸变异, 筛选出201个代表性单核苷酸变异, 进而逐级划分出130个亚谱系, 绘制成完整的反映各个谱系之间亲缘关系的单倍型网络图, 同时建立了实时更新的配套网站以方便查看 。
为阐明不同亚谱系病毒的流行程度是否有所不同, 研究团队依据谱系划分系统对有具体采样时间信息的119168个高质量病毒基因组进行划分, 分析结果显示, 在地理条件、交通运输、文化风俗、防疫政策、超级传播者等各种因素共同作用下, 病毒谱系在不同地域间有各自独特的分布模式 。
研究团队还收集了国内从2020年4月到2021年1月的输入病例数据, 将其在谱系划分系统单倍型网络上进行展示, 可以为输入型病例的来源提供推断信息 。
【新冠病毒基因组演化分析有重要进展】此项研究囊括了目前出现的绝大多数新冠基因组变异, 并整理了其谱系关系, 阐明各个谱系时空分布的规律, 搭建出新冠病毒演化的大体框架, 对理解病原体变异规律、新冠流行病学追踪、预测病毒的演化方向有重要意义 。

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