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疫苗免疫
目前我国已研制成功预防仔猪大肠杆菌腹泻的K88-LTB基因工程活菌苗（简称MM活菌苗），有K88、K99、987P、F41的单价或多价灭活菌苗，在母猪产前4～6周免疫，使新生仔猪通过哺乳获得保护 。
自制灭活菌苗
由于大肠杆菌的血清型很多，因此有条件的猪场可通过分离本场的致病菌，制成灭活菌苗，这样针对性较强，效果好 。
抗血清的被动免疫
利用分离的致病菌株制成的抗血清或经产老母猪的血清对初生仔猪进行注射或口服，可减少疾病的发生 。
药物预防
可在仔猪出生后全窝用抗菌药口服，连用3天，预防发病 。
加强饲养管理
【仔猪黄痢预防措施】注意提高产房的温度，严防受凉 。要让仔猪吃足初乳，做好卫生和消毒工作，保持猪舍环境的清洁、干燥 。
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