在番茄生产过程中，常会出现植株萎蔫，如果防治不及时，会给菜农造成较大的损失，菜农应针对不同原因造成的萎蔫对症防治 。
一、病害引起的萎蔫
能够导致番茄萎蔫的病害有很多，如枯萎病、根腐病等都会影响番茄根系的吸水能力，番茄发生萎蔫 。枯萎病和根腐病在发病初期都会导致番茄中午发生萎蔫，早晚尚能恢复 。数日后植株出现死亡 。在发病初期使用多菌灵混加福美双进行喷雾预防，发病后使用乙蒜素加恶霉灵灌根，发病严重时可用氯溴异氰脲酸或普力克灌根 。
二、灌水不当引起萎蔫
灌水不当导致的植株萎蔫有两种情况：一是土壤却是导致番茄萎蔫，但这种情况在浇水后就能使番茄的萎蔫情况得到解决；二是因为灌水时水温较低，地温较高，导致毛细根受伤，吸水不足引起萎蔫，应注意在造成刚拉起草帘时立即进行浇水，或者在早晨浇水后及时将草帘拉起 。
三、肥害引起萎蔫
由于施肥过多，特别是靠近黄瓜根颈部施用化肥时，极易灼伤植株，施用含氮量较高的肥可在大棚内分解过程中产生氨气，当气温升高时，氨气浓度过大导致萎蔫死株 。要注意少施速效性化肥，多施腐熟的有机肥，并进行根外追肥，可喷施复合磷酸二氢钾、喷施宝等叶面肥 。
四、温度不适引起萎蔫
【棚室番茄为什么发生萎蔫】中午光照强烈且棚温高于35℃，导致番茄叶片水分蒸发强烈，植株就会出现萎蔫，严重时导致番茄的叶缘呈烧伤状，此时应注意通风，并将棚内温度控制在28℃以下即可有效避免 。低温植株生长受抑，遇到晴天特别是早晨太阳出来，棚内温度迅速升高，而根系却难以迅速吸水引起萎蔫，此时应在光照过强的中午覆盖草苫降低光照，及时打顶抑制生长，喷施磷酸二氢钾一次 。
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