从嫁接开始，到辣椒苗开始明显生长后结束，在苗床条件适宜时，约需要10天时间 。此阶段如果温度偏高、空气干燥或通风量过大，接穗容易发生萎蔫，会明显降低嫁接苗的成活率 。因此，此阶段对育苗床的环境要求比较严格，具体要求和管理要点如下：
温度此阶段苗床的适宜温度为25~30℃，最高不超过32℃ 。温度过高，辣椒苗失水加快，容易发生萎蔫 。温度偏高时，要用遮阳网对苗床进行遮阴 。此期，如果温度长时间偏低，辣椒苗与砧木间的接合慢，嫁接苗的成活率和壮苗率也较低，一般要求苗床内的最低温度不低于20℃ 。为确保苗床的温度需要，低温期要将嫁接安排在晴暖天气进行，同时还需要加强苗床的增温和保温工作 。
湿度此阶段要求比较高的湿度，特别是嫁接3天后要保持90%以上，在适宜的空气湿度下，嫁接苗表现为叶片开展正常、叶色鲜艳，上午日出前叶片有吐水现象，中午前后叶片不发生萎蔫 。一般嫁接后3天内不会发生空气干燥现象，如果发生干燥现象，则要在早晨或傍晚沿苗行间浇水，注意不要叶面喷水，以免污水流入嫁接口内，引起接口腐烂 。通常从第4天开始，要适当通风，降低苗床内的空气湿度，防止嫁接苗发生病害 。苗床通风发生萎蔫时，要及时合严棚膜，萎蔫严重时，还要对嫁接苗进行叶面喷水 。在通风时间安排上，要先早晚，渐至中午，嫁接苗不发生萎蔫的可全天通风 。当苗床开始大通风后，育苗钵土容易干燥，要及时浇水，始终保持育苗土不干燥 。
光照此阶段要求散射光照，直射光容易引起嫁接苗温度过高，失水加快，发生萎蔫 。在管理上，此阶段白天要用遮阳网对苗床进行遮光，避免强光直射苗床 。从第3天开始，要逐渐缩短白天苗床的遮光时间，加强苗床内的光照，防止嫁接苗因光照不足导致叶片发黄、脱落以及诱发病害等 。一般前几天先将苗床遮成花荫，后过渡到不遮阴，如光照适宜，则嫁接苗表现为遮光前和除掉遮阳物后不发生萎蔫 。
嫁接苗成活至定植阶段，育苗环境与常规育苗方法不同，其区别有以下几方面：
【辣椒苗嫁接很有学问】弱苗需加强管理当大部分嫁接苗转入旺盛生长后，要将苗床中生长不良的弱苗挑出，集中于一个苗床内继续给予适温、遮光和高湿度管理，促其生长 。
断茎与抹根对靠接苗，还要选阴天或晴天下午，用刀片将辣椒苗茎从接口下切断，使接穗辣椒苗与砧木完全进行共生 。断茎后的几天，嫁接苗容易发生萎蔫和倒伏，要对苗床进行适当的遮阴 。对发生倒伏的嫁接苗要及时用枝条或土块等支扶起来，一般1周后便可转入正常的管理 。对砧木苗茎上长出的侧枝以及接穗辣椒苗上长出的不定根，要随时发现随时抹掉 。
不要过早摘掉嫁接夹靠接苗和劈接苗上的嫁接夹不要摘掉，留下来保护接口，一般在苗子定植于大田并支架固定后摘掉为宜 。
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