棉花蚜虫的防治以农业防治和生物控制为主，化学防治为辅 。
1、农业防治
⑴种植抗虫品种是防治棉花蚜虫的有效措施，如种植372等 。
⑵间作套种，可以增加天敌的种类和数量，控制蚜虫为害 。如棉麦套种；棉花与绿豆、绿肥等间作；插花种植玉米、油菜、高粱等诱集作物 。
⑶水旱轮作可以减轻棉蚜的发生 。有条件的地方实行棉花和水稻轮作 。
⑷处理越冬寄主，减少早春蚜源 。一般在棉苗出土前，清除棉田内外杂草 。有可能对花椒、石榴、木槿和冬青四大棉蚜越冬寄主进行药剂治理，可减轻棉田蚜量 。
2、药剂防治
⑴拌种
棉花播种前按亩用种子量与3%呋喃丹颗粒剂1.5～2千克，混拌均匀，或用铁灭克（也叫涕灭威）拌种，每亩用有效成分50克，能控制蚜害40～50天 。用3911（甲拌磷）乳剂或颗粒剂、种衣剂拌种，效果也很好 。
⑵滴心和涂茎防治蚜虫
用40%氧化乐果乳剂或40%久效磷或50%甲胺磷乳剂稀释80～100倍，用喷雾器将药液滴在棉苗顶部能控制蚜害 。
用40%氧化乐果乳剂或40%久效磷或50%甲胺磷乳剂、聚乙烯醇和水，按1：0.1：5的比例配制成涂茎剂，用类似毛笔的器具，将药液涂在棉花茎上紫绿相间部位，防蚜虫效果可达90%以上 。
⑶喷药防治
用50%久效磷、50%辛硫磷、40%氧化乐果、40%毙蚜丁、35%伏杀蚜、50%磷胺等药剂稀释1000～1500倍喷雾 。
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