香菇生产与水分、营养、温度、空气、光线、PH值等因子有关 ， “烂棒”的发生与栽培管理直接相关 。香菇虽是需光性真菌 ， 但在菌丝营养生长阶段完全不需要光线 ， 强烈的直射光对香菇菌丝有抑制作用和致死作用 ， 因此 ， 发菌阶段要做好遮光工作 。
香菇是好气性真菌 ， 在缺氧的情况下菌丝借酵解作用暂时维持生命 ， 但消耗大量的营养 ， 菌丝易衰老 ， 死亡快 ， 因此应即时做好刺扎增氧工作 。
夏天高温 ， 香菇菌丝会遭受高温影响 ， 发菌场所选择好坏 ， 措施是否得当直接关系栽培成功与否 。散堆及时 ， 降温措施到位的 ， 菌棒烂棒较少 ， 而管理不当的 ， 往往造成大量菌棒烂棒 。
在菌筒发生生理性病害时应当及时采取措施加以防治 。当菇筒出黄水阶段应用消毒后的竹尖将菌筒刺破让黄水排出 ， 并用沾有消毒药水的棉布将黄水吸出；若发现菌筒局部出现污染与烂筒 ， 应及时去除烂筒部位的营养料 ， 采用注射法注入香菇烂筒防治剂或200倍多菌灵与甲基托布津并盖上一层石灰粉 ， 另放置在干燥阴凉通风的其他培养室观察培养 ， 防止交叉感染 。防治香菇烂筒的“烂筒病”是一个综合防治的过程 。从接种到培养菇筒 ， 到下田排筒都要做好消毒防治工作 。不能有任何的疏忽大意 ， 每一个生产环节都要十分注意做好病虫防治工作 ， 避免发生生理性病害；一旦发现病虫害入侵 ， 就要及时做好杀虫与灭菌工作 ， 将烂筒损失降低到最低程度 。
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