由于安装过程依赖于软件包之间的依赖关系，因此可能会出现比较复杂的情况 。例如Ports Collection的源代码不完整，缺乏它所依赖的软件包的信息，这样安装就不能正常完成 。还有就是Ports Collection之间不一致，由于软件的版本不同，就可能造成依赖关系不完整，安装过程不能继续进行 。这就需要使用者检查依赖关系，更新整个Ports Collection来纠正问题 。
有的软件，本来就是提供的二进制形式的软件，例如Netscape Communicator，因此并不需要编译过程 。所需要的仅仅是将它们下载并安装 。即便如此，使用Ports Collection仍然能够帮助使用者更方便的完成这项工作 。因为Ports Collection仍然维护着一些有用的信息，例如要下载的应用软件版本号和应用软件的下载位置，应用软件的安装目录和配置文件所在的目录等非常有用的信息 。使用包的方式进行安装和管理，将保证应用软件之间的依赖关系的完整性，方便在不用的时候将包卸载，此外Ports Collection还将按照FreeBSD的习惯来组织文件和目录，便于将要安装的文件放置到合适的位置中 。
通常FreeBSD将应用软件安装到/usr/local目录下（X Window应用软件安装到/usr/X11R6目录下），其执行程序位于/usr/local/bin中，配置文件位于/usr/local/etc中，而应用软件如果需要在系统启动时自动启动，相应的启动文件被放置到/usr/local/etc/rc.d目录中 。
未完，待续 。。。
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