永元十四年(102年)夏，阴皇后因搞巫蛊活动而废除，邓绥请求挽救没有成功，和帝便更属意于邓绥 。邓绥更加说自己的病十分严重，深居闭户以绝和帝之召幸 。这时管事人奏请重立皇后，和帝说：“皇后之尊，与我皇帝位同一体，同等贵重，承祀宗庙社稷，为天下母，不容易啊!只有邓绥品德为后宫之首，才可以当得起 。”到冬天，立邓绥为皇后 。再三推辞谦让，然后登皇后位 。亲手写好谢恩的奏书，深深陈述自己德行菲薄，不足以充当君王妻室的人选 。这时，四方诸侯之国，贡献方物，争求得珍贵华丽之物，自邓绥入主中宫，一律禁绝，岁时季节只要供给纸墨就行了 。和帝每次想封爵邓绥家族，邓绥往往谦让苦苦哀求不让进行，所以邓绥的哥哥邓骘在整个和帝之世不过是一位虎贲中郎将而已 。
临朝称制
元兴元年(105年)，和帝驾崩，长子平原王刘胜以痼疾不得立，而诸皇子夭没，前后以十数，后生的往往隐秘地养于人间 。殇帝刘隆生下只百余日，邓绥迎立即皇帝位 。尊邓绥为太后，临朝听政 。
和帝安葬后，宫人都归园，邓绥赐周、冯贵人策书说：“我与贵人托皇上的福荫都配于后庭，一同享受欢乐，十有余年 。没有更多的获得幸福和庇佑，而先帝早弃天下，茕茕孤独，失去了依靠，日夜悲伤，不能自已，现应当照老规矩分别归于外园，惨郁凝结，徒增哀叹，以前卫国庄姜送归妾《燕燕》之诗，泣涕长诀，分飞惨叹的情景也是不能比拟的啊!今赐贵人王青盖车，采饰辂，骖马各一驷，黄金三十斤，杂帛三千匹，白越四千端 。”又赐冯贵人王赤绶，因没有头上步摇、环佩，加赐各一具 。
当时刚刚遭到大的忧患，法规禁条没有完备 。宫中大珠一箧不见了，邓绥想来，如果加以拷问，必定伤及无辜 。于是亲自检阅所有宫人 。冷静仔细地察颜观色，偷窃者马上就自首服罪 。又和帝宠幸者吉成，驾车的一起冤枉吉成有挟邪弄巫蛊惑的坏事，于是下掖庭狱拷问审讯，供辞证言明白无误 。但邓绥认为吉成常在先帝左右，平日待之有恩，尚无恶言，今竟反而如此，不合人情，便自己叫有关人等进行核实，结果，是驾车人自己所为 。宫中没有不叹服的，认为邓绥圣英明哲 。
恩施天下
邓绥常以鬼神难于征信，太多的祭祀没有好处 。于是诏令管事人罢去不合典礼的诸祠官 。又诏令赦免自光武帝建武以来所犯妖言巫恶，及马、窦家属所被禁锢永不得仕者，都免为平民 。减去大官、导官、尚方、内者所管膳馐、择米、刀剑、帷帐等一切服御珍膳靡丽难成的物件，如非供祀陵庙，稻粱米不得选择，早晚一肉饭就行了 。旧太官汤官常年要用二万万，邓绥敕令停止，每日减少节省用费，自此裁去数千万 。郡国所贡纳的物品，都减去半数以上 。上林苑的鹰犬，一律卖掉 。蜀郡、广汉郡供进的金银缘器以及九带佩刀，一并不再上调 。停止画工三十九种 。又御府、尚方、织室锦绣、冰纨、绮鄃、金银、珠玉、犀象、王毒瑁、雕镂等玩弄之物，都停止不作 。离宫别馆蓄积的米粮薪炭，一律省去 。又诏令诸园贵人、宫人有宗室同族若体弱年高、不堪使用的，叫园监核实上报名册，亲自到北宫增喜观检阅询问，听他们自己决定去留，当日免除遣散了五六百人 。
殇帝驾崩，邓绥决定立安帝刘祜，仍临朝听政 。因接连遭受和帝、殇帝去世，老百姓苦于差役，殇帝康陵秘藏，诸丧葬工作，事事减省节约，只有常规的十分之一 。
【邓绥生平简介资料，邓绥生平事迹，邓绥是谁的皇后？】邓绥诏令司隶校尉、河南尹、南阳太守说：“往往看到前代外戚宾客，假借皇亲权威，轻薄虚浮，以至浊乱奉公，为民恶患 。毛病就在于执法怠惰松懈，不即时执行惩罚的缘故 。今车骑将军邓骘虽胸怀敬顺之志，而宗族广大，姻戚不少，宾客奸诈狡猾，多数干犯禁令宪章 。应明白加以检查整饬，不要相与宽容庇护 。”从此亲属犯罪，没有任何原宥赦免 。邓绥怜愍阴皇后因罪而废，敕免因她而流放的亲属回原籍，赦令归还资财五百余万 。
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