当然可以，你可以跟公司这些协约一起申请 ， 还可以签订合作协议明确著作权的归属问题 。
【软件著作权可以联合申报吗】建议您个人申请该软件的著作权 ， 随后与该公司签订著作权使用合同，授权该公司进行销售及维护 。这样您才是著作权法上所称的“作者”，享有署名权、修改权及复制权等 。
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