ncbi是什么数据库,mega软件是以什么数据库为基础的

ncbi是什么数据库

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【ncbi是什么数据库,mega软件是以什么数据库为基础的】NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写,指美国国家生物技术信息中心 , 建立于1988年 。NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统 , 除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具 。
mega软件是以什么数据库为基础的mega软件是以生物信息学数据库(NCBI、EMBL以及DDBJ等)为基础的 。
助:怎么从基因组数据库中找出某基因家族如果你知道你要找的基因的名字应该是可以很快的找到你要的序列,那你只能通过做比对来判断了一般提交NCBI上的基因组都有预测CDS的,所以上面都有标出每个CDS的可能功能及相应蛋白或酶的名字 。如果没有 。可以用BIOEDIT比对试试
credit reference是什么意思Reference Seq 其实是NCBI下的一个算作子库一样的数据库,包括基因组DNA , 转录组,蛋白组数据,说白了是经过人工校验过的数据库 , 一般比较真实可靠且不冗余,你可能也发现了在NCBI中一个基因会有多个版本 , 但是经过校正进入RefSeq的一个基因一般只有一个序列 当然转录本一般不止一条 , 要是查询比对什么的用这个库比较靠谱,详见生物信息的书吧
unigene是什么意思一种生物信息学数据库 。
人类基因组计划的首要任务是对人类基因组进行全序列测定,整个基因组估计有30亿个碱基对,其中大约3%可以编码蛋白质,其余部分的生物学功能还不清楚 。转录图谱可以把基因组中能够编码蛋白质的部分集中起来,因此是一种重要的数据资源 。UniGene试图通过计算机程序对GeneBank中的序列数据进行适当处理,剔除冗余部分 , 将同一基因的序列,包括EST序列片段搜集到一起,以便研究基因的转录图谱 。UniGene除了包括人的基因外,也包括小鼠、大鼠等其它模式生物的基因,HGI数据库只包括人的基因 。该数据库的标题行(TITLE)给出基因的名称和简单说明,表达部位行(EXPRESS)指出该基因在什么组织中表达以及在基因图谱中的位置等 。此外 , 列出该基因在核酸序列数据库GenBank或EMBL和蛋白质序列数据库SWISS-PROT中的编号的超文本链接 。UniGene中部分条目包括已知基因序列,而有些条目则仅有新测得的EST序列片段 。这就意味着,这些EST序列所对应的基因尚未搞清,可以用来发现新基因 。在描绘基因图谱及大规模基因表达分析等研究中,UniGene也可以帮助实验设计者选择试剂 。UniGene可以通过NCBI或SRS系统访问 。

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