1、药剂处理：50%和穗安可湿性粉剂、25%粉锈宁可湿性粉剂、40%拌种双可湿性粉剂 ， 用种子量的0.2%拌种均能收到良好效果 。上述处理后的种子和包衣剂混合然后拌种 ， 可以提高防治效果 。有些药剂在拌种时注意不要超过规定量 ， 以免发生药害 。
【小麦黑穗病如何防治】2、生理杀菌处理：用生石灰和消石灰0.5公斤 ， 加清水50公斤 ， 可浸麦种30—50公斤 ， 水温在20℃时浸3—4天 ， 25℃时浸2—3天 ， 35℃时只需1天 。浸完后晾干播种 。此方法操作简便 ， 取材容易 ， 效力也很高 ， 明显优于温汤浸种 。在浸种过程中 ， 麦种不易不过多 ， 以种子厚度2尺为宜 ， 以防底部种子发热霉变 。
3、繁殖无病种子：在良种场或种子繁殖基地繁殖无病种子 。种田距离大田至少在100米以外 ， 所用种子 ， 必须经过严格的处理 ， 保证全部无病 。做好无病种子的繁殖工作是防治此病的根本措施 ， 可以免去种子处理的繁重工作 。
4、选育抗病品种：小麦散黑穗病菌生理小种变异速度较为缓慢 ， 小麦对散黑穗病抗性是单基因显性遗传 ， 抗原也丰富 ， 有利于抗原品种的选育 。在选育抗病品种中 ， 可以利用病菌不能进入胚内 ， 或进入胚内但在分生组织发育上有差异 ， 以及闭花授粉避病的特点进行选育工作 。
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