在生化3中敌人更快更强更多了，而主角也同样变得更加强大，制敌手段变的更加多样化，游戏人物之间的互动也比2代更加的频繁，人物性格也更丰满 。但种种这些，并不能改变《生化危机3》其实本该是《生化危机2》的一部外传的实事，而这更是出自生化之父三上真司本人之口，大意是生化危机3本来的定位有点类似于《生化危机2.5》，即是为了补完生化2剧情而存在的外传性质的篇章 。
而不管如何，生化3都是一款非常优秀的游戏，在“老生化”中，它是操作最为流畅，操作感最佳的一作 。老生化的终结看到这里，可能会有人问，“真正的生化3”到底是哪一作呢？答案其实已经昭然若揭，它就是老生化系列的最后一作：《生化危机：代号维罗妮卡》如果仔细的对比维罗妮卡和生化3，你就会发现其实维罗妮卡的故事和生化2衔接的更加紧密，2代的女主角是维罗妮卡的女主角，而在维罗妮卡中也提到了2代的男主角里昂，从时间线上更是紧密衔接着2代 。
相比起来，生化3中反而基本没有涉及到生化2中的任何内容，而是完全从另一个角度展开故事 。实际上，卡普空当年也是准备将维罗妮卡命名为《生化危机3：代号维罗妮卡》，而由于在游戏制作过程中的种种困难，以及NGC平台独占策略，使得卡普空对这一作信心非常缺乏，再加上计划的开发周期较长，卡普空不想让生化危机这样的金字招牌冷下来，便赶鸭子上架，将原本的《生化危机2.5》改名为《生化危机3：复仇女神》上架发售了 。
然而，出乎意料的是生化3发售后很快就突破了百万销量，而维罗妮卡则遭遇滑铁卢 。平心而论，维罗妮卡的游戏质量上乘，和生化3是处在同一层次上 。无论是游戏内容的丰富度，还是游戏性和人物刻画都处于”老生化”的巅峰水准，更是首次在“老生化”中采取了动态的背景，所以维罗妮卡的游戏体验和前几作是完全不同的，这也是维罗妮卡能在众多外传作品中脱颖而出的重要原因之一 。
然而时值千年之交，随着电脑技术的飞速发展，游戏产业也是瞬息万变，维罗妮卡在销量上的惨败让卡普空认识到“老生化”的套路也许无法再继续用下去了 。“新生化”时代维罗妮卡的失败经验告诉卡普空，生化危机系列是时候变革了 。彼时恰逢卡普空与任天堂合作的NGC主机惨败，为了挽回颓势，三上真司对于《生化危机4》的开发几乎倾注了全部的心血 。
（值得一提到的是虽名为生化之父，但三上真司亲自负责开发的作品只有生化1和生化4两部）当时，单单为生化4准备的剧本就有3套，而大家所熟知的《生化危机3.5》其实也经历了3次推倒重来，最后一次的剧本是主角身中生化病毒，产生了奇特的幻觉，在幻觉中与鬼怪进行对战 。这样的设定虽然奇特又恐怖，但卡普空高层认为这和生化系列的概念相去甚远，便命令三上推倒重来，这才有了我们今日所见到的史诗之作《生化危机4》《生化危机4》比起前作有了翻天覆地的变化，这种变化是跨世代的，游戏从恐怖生存巨变成FPS生存游戏（这也为后面几代彻底变成射击游戏埋下了伏笔），极大的削减了游戏中的解密内容，剧情的推动再也不需要经过繁琐的解开各种机关或者找到各种钥匙，“如果你不知道该怎么前进，只需要杀光所有的敌人就行了” 。
当然，本作中最重要的改变可能就是取消了丧尸这种敌人，这必然会让很多老生化玩家感到难以接受，毕竟丧尸才是生化危机的立足之本 。但根据三上真司本人的想法，他认为丧尸出现的已经够多了，玩家们大概已经感到厌烦了 。毫无疑问，这是一种更加符合游戏潮流的变动，也为生化系列带来的新的生机 。虽然充满争议，但过硬的游戏素质还是征服了玩家的心，使得生化4成为了继生化2之后传播最广最知名的一作，在过去的十多年中，生化4也经历了无数次的高清化，重置，移植，到了2020年，你几乎可以在任何一个平台上找到生化4的影子 。
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