3.发票的内容不同：增值税专用发票除了具备购买单位、销售单位、商品或者服务的名称、商品或者劳务的数量和计量单位、单价和价款、开票单位、收款人、开票日期等普通发票所具备的内容外，还包括纳税人税务登记号、不含增值税金额、适用税率、应纳增值税额等内容 。4.发票的联次不同："增值税专用发票有四个联次和七个联次两种，第一联为存根联(用于留存备查)，第二联为发票联(用于购买方记账)，第三联为抵扣联(用作购买方扣税凭证)，第四联为记账联(用于销售方记账)，七联次的其他三联为备用联，分别作为企业出门证、检查和仓库留存用;普通发票则只有三联，第一联为存根联，第二联为发票联，第三联为记账联 。
在发票内容的构成要素上，增值税专用发票将票面金额一分为二，勾稽关系为“金额 税额=价税合计”，其中：“金额*税率=税额” 。由于普通发票不具有抵扣进项税额的功能，因此，无需将价税分列开具，只需将价税合计合并开具为“金额” 。另外，在其他方面也有不同之处，如：增值税专用发票需列明购销双方的税务登记号，等 。这些不同之处均是增值税专用发票具有抵扣功能所致 。
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