如何使用NCBI工具

1、01首先,我们打开NCBI官网页面,在页面上方搜索框中,选择要下载的基因序列类别,这里我们需要选择“Nucleotide”选项02接下来,我们就需要输入具体的名称了,这里我输入的是Kinase,代表一种酶,然后点击“search”按 。
2、NCBI无法查询蛋白质等电点,可以到swissprot查询这个NCBI没有相关的功能,这个是以核苷酸序列为主因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,可以到swissprot进行查询,查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询另外NCBI开发有 。
3、首先打开ncbi主页 在搜索框左边的下拉菜单选择quotGenequot,并输入要找的基因名称最好是正式名称缩写或者常用名称,例如想找人的超氧化物歧化酶1的基因,就输入Superoxide dismutase 1或者 。
4、CDScoding sequence序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列 在NCBI Nucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列 在出现的结果中,有CDS 这一项,底下的核酸序列就是该基因的蛋白编码区 Enjoy it 。

如何使用NCBI工具


5、1第一,在坐标数据的基础上,标出所有的构成蛋白质的核心部分的α螺旋和β片层然后根据这些二级结构单位的位置计算向量以下的步骤使用这些向量来做对比而不是整个一套坐标2然后,算法试图最佳的匹配这些向量,寻找 。
6、进 入Mapviewer的方法如下点击NCBI首页的Map viewer 进入Map viewer的首页,在Search下拉框内选择你寻找基因的生物种类egHomo sapienshuman在后面输入你基因的名称eghcn4或者是关键词hypertension单击go 。
如何使用NCBI工具


7、1 打开NCBI主页 2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称 3 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫选择你想要的种属4 再出现的页面中找到那个像数轴的图 。
8、1在NCBI上查找基因的mRNA序列2Messenger RNA mRNA信使核糖核酸信使核糖核酸 携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA信使RNA 从脱氧核糖核酸DNA转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸RNA它在 。
9、除了建有GenBank核酸序列数据库该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具 。
【如何使用NCBI工具】10、你进入protein的entrez,用蛋白质accession number查找到蛋白质之后会给你连接的,每个蛋白质不一样 如果没有nc号,就用blast搜索,使用tblastn工具,最前面的一个就是相应的dna 顺便给你一个另外的答案参考下 。
11、先来讲讲NCBI的用FTP登陆windows下可以直接打开或是用迅雷Flastget等下载工具cd geneDATAwindows下依次找到geneDATA这个文件夹ls一下,里面的文件大概有ncftp geneDATA ls ASN_ 。
12、cgi?PROGRAM=blastnBLAST_PROGRAMS=megaBlastPAGE_TYPE=BlastSearchSHOW_DEFAULTS=onLINK_LOC=blasthome 进入这个网址,把你所要比对的序列输入序列框中,在下面的选项中选择对应 。
13、查mRNA的话,在NCBI主页上All Databases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧Top Organisms中可以看到在某个物种里面共提交了共 。

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