采用常规方法催芽时，常常出现酒糟气味 。种子出现酒糟气味多半发生在破胸的高峰期，因为这个时期种子呼吸作用非常旺盛，需要大量氧气，如果不及时对种子进行翻堆散热、通气，种子堆中心部分很容易产生40℃或更高的高温，使种子产生缺氧呼吸，引起酒精积累中毒，并随之产生酒糟气味 。因此，不少时候高温烧芽常和种子产生酒糟气味同时出现 。有了酒糟气味的种芽也常常受到了高温的暗伤 。被高温烧伤的种子，酶的活性遭到破坏，发芽慢而不整齐，或不能发芽而成为盲谷 。已发芽的种芽出现畸形（如芽弯曲、幼根缺乏根毛等），根尖和芽尖变黄甚至枯死 。严重时种子表面粘手，发出浓厚的霉味，甚至使已长出的根芽变黄 。如果把这样的种子播到秧田里，其结果是：伤在屋里，烂在田里 。
为了防止烧芽和产生酒糟气味，在整个催芽过程中，必须经常检查堆内温度变化，破胸以后，发现堆温达到32℃时，应及时翻堆散温 。如果发生轻微酒糟气味时，应立即采取措施，松堆摊晾，以降低堆温，并用温水清洗，然后再上堆催芽 。
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