pcr技术原理和三个主要步骤


pcr技术原理和三个主要步骤


实验方法原理:
实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法 。
实验步骤:
一、 样品RNA的抽提
1. 取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解 。
2. 两相分离 每1 ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2 ml的氯仿,盖紧管盖 。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟 。4℃下12 000 rpm离心15分钟 。离心后混合液体将分为下层的红色酚氯仿相,中间层以及无色水相上层 。RNA全部被分配于水相中 。水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60% 。
3. RNA沉淀 将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中 。加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA,混匀后15到30℃孵育10分钟后,于4℃下12 000 rpm 离心10分钟 。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块 。
4. RNA清洗 移去上清液,每1 mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1 ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀 。混匀后,4℃下7 000 rpm离心5分钟 。
5. RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟 。
6. 溶解RNA沉淀 溶解RNA时,先加入无RNA酶的水40μl用枪反复吹打几次,使其完全溶解,获得的RNA溶液保存于-80℃待用 。
二、 RNA质量检测
1. 紫外吸收法测定
先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零 。然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液 浓度和纯度 。
(1)浓度测定
A260下读值为1表示40 μg RNA/ml 。样品RNA浓度(μg/ml)计算公式为:A260 ×稀释倍数× 40 μg/ml 。具体计算如下:
RNA溶于40 μl DEPC水中,取5 μl,1:100稀释至495 μl的TE中,测得A260 = 0.21
RNA 浓度= 0.21 ×100 ×40 μg/ml = 840 μg/ml 或 0.84 μg/μl
取5 ul用来测量以后,剩余样品RNA为35 μl,剩余RNA总量为:
35 μl × 0.84 μg/μl = 29.4 μg
(2)纯度检测
RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.8到2.1 。
2. 变性琼脂糖凝胶电泳测定
(1)制胶
1 g琼脂糖溶于72 ml水中,冷却至60℃,10 ml的10× MOPS电泳缓冲液和18 ml的37% 甲醛溶液(12.3 M) 。
10×MOPS电泳缓冲液
浓度 成分
0.4 M MOPS,pH 7.0
0.1 M 乙酸钠
0.01 M EDTA
灌制凝胶板,预留加样孔至少可以加入25 μl溶液 。胶凝后取下梳子,将凝胶板放入电泳槽内,加足量的1×MOPS电泳缓冲液至覆盖胶面几个毫米 。
(2)准备RNA样品
取3 μgRNA,加3倍体积的甲醛上样染液,加EB于甲醛上样染液中至终浓度为10 μg/ml 。加热至70℃孵育15分钟使样品变性 。
(3)电泳
上样前凝胶须预电泳5 min,随后将样品加入上样孔 。5-6 V/cm电压下2 h,电泳至溴酚兰指示剂进胶至少2-3 cm 。
(4)紫外透射光下观察并拍照
28S和18S核糖体RNA的带非常亮而浓(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),上面一条带的密度大约是下面一条带的2倍 。还有可能观察到一个更小稍微扩散的带,它由低分子量的RNA(tRNA和5S核糖体RNA)组成 。在18S和28S核糖体带之间可以看到一片弥散的EB染色物质,可能是由mRNA和其它异型RNA组成 。RNA制备过程中如果出现DNA污染,将会在28S核糖体RNA带的上面出现,即更高分子量的弥散迁移物质或者带,RNA的降解表现为核糖体RNA带的弥散 。用数码照相机拍下电泳结果 。
三、样品cDNA合成
1. 反应体系
序号 反应物 剂量

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