氯是植物必需营养元素之一 。它在植物体内有多种生理作用 。概括起来，主要是少部分氯参与生化反应，而大部分氯以离子状态维持各种生理平衡 。当缺氯时，会影响植物生长，但常年施用含氯化肥，土壤中氯离子过多时，对植物也有毒害作用 。在许多情况下氯害虽未达到出现可见症状程度，但轻则抑制植物生长，重则减产 。这正是滨海盐土上常常发生盐害的原因之一 。
由于各种作物对氯的敏感程度不同，糖用甜菜、水稻、小麦、玉米、菠菜和番茄属于对氯不敏感的作物，而烟草、菜豆、马铃薯、柑桔、葡萄、西瓜、莴苣和一些豆科作物则属于对氯敏感的作物，所以易遭受氯的毒害 。
因此，对氯敏感的作物，施用氯化铵和氯化钾含氯化肥时，常会影响产品的质量 。例如氯过多会降低烟草的燃烧性，气味不好；氯过多使薯类作物的淀粉含量下降，品质差；氯过多会降低果品的糖分，而酸度较高，使果品风味欠佳等 。应当指出，含氯化肥却能堤高纤维作物如棉花、亚麻等的品质 。
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