不过关于这种古代遗传系统并没有直接证据，且由于DNA在环境中无法存留超过一百万年，在溶液中又会逐渐降解成短小的片段，因此大多数化石中并无DNA可供研究 。即使如此，仍有一些声称表示已经获得更古老的DNA，其中一项研究表示，已从存活于2亿5千万年古老的盐类晶体中的细菌分离出DNA，但此宣布引起了讨论与争议 。
6技术应用
6.1遗传工程
参见：分子生物学及遗传工程
重组DNA技术在现代生物学与生物化学中受到广泛应用，所谓重组DNA，是指集合其他DNA序列所制成的人造DNA，可以质体或以毒载体搭载所想要的格式，将DNA转型到生物个体中 。经过遗传改造处里之后的生物体，可用来生产重组蛋白质，以供医学研究使用，或是于农业上栽种 。
6.2法医鉴识
参见：遗传指纹分析
法医可利用犯罪现场的血液、、皮肤、唾液或毛发中的DNA，来辨识可能的加害人 。此过程称为遗传指纹分析或DNA特征测定，此分析方法比较不同人类个体中许多的重复DNA片段的长度，这些DNA片段包括短串联重复序列与小卫星序列等，一般来说是为可靠的罪犯辨识技术 。不过如果犯罪现场遭受多人的DNA污染，那么将会变得较为复杂难解 。首先于1984年发展DNA特征测定的人是一名英国遗传学家阿莱克·杰弗里斯 。到了1988年，英国的谋杀案嫌犯科林·皮奇福克，成为位因DNA特征测定证据而遭定罪者 。利用特定类型犯罪者的DNA样本，可建立出数据库，帮助调查者解决一些只从现场采集到DNA样本的旧案件 。此外，DNA特征测定也可用来辨识重大灾害中的罹难者 。
6.3历史学与人类学
参见：种系发生学及遗传系谱学
由于DNA在经历一段时间后会积聚一些具有遗传能力突变，因此其中所包含的历史讯息，可经由DNA序列的比较，使遗传学家了解生物体的演化历史，也就是种系 。这些研究是种系发生学的一部分，也是演化生物学上的有利工具 。假如对物种以内范围的DNA序列进行比较，那么群体遗传学家就可得知特定族群的历史 。此方法的应用范围可从生态遗传学到人类学，举例而言，DNA证据已被试图用来寻找失踪的以色列十支派 。DNA也可以用来调查现代家族的亲戚关系，例如建构莎丽·海明斯与托马斯·杰斐逊的后代之间的家族关系，研究方式则与上述的犯罪调查相当类似，因此有时候某些犯罪调查案件之所以能解决，是因为犯罪现场的DNA与犯罪者亲属的DNA相符 。
6.4生物资讯学
参见：生物资讯学
生物资讯学影响了DNA序列资料的运用、搜寻与资料挖掘工作，并发展出各种用于储存并搜寻DNA序列的技术，可进一步应用于计算机科学，尤其是字串搜寻算法、机器学习以及数据库理论 。字串搜寻或比对算法是从较大的序列或较多的字母中，寻找单一序列或少数字母的出现位置，可发展用来搜寻特定的核苷酸序列 。在其他如文本编辑器的应用里，通常可用简单的算法来解决问题，但只有少量可辨识特征的DNA序列，却造成这些算法的运作不良 。序列比对则试图辨识出同源序列，并定位出使这些序列产生差异的特定突变位置，其中的多重序列比对技术可用来研究种系及蛋白质的功能 。由整个基因组所构成的资料含有的大量DNA序列，例如人类基因组计划的研究对象 。若要将每个染色体上的每个基因，以及负责调控基因的位置都标示出来，会相当困难 。DNA序列上具有蛋白质或RNA编码特征的区域，可利用基因识别算法辨识出来，使研究者得以在进行实验以前，就预测出生物体内可能表现出来的特殊基因产物 。
6.5DNA与电脑
参见：DNA运算
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