二，用废弃的菌棒种植其他品种 。
种植平菇完毕，废弃的菌袋中，营养并没有100%的被平菇吸收和消耗，还有很大一部分的残留，据专业人员化验测算，废棒中的有机质最低还有20%以上，最多时能达到将近50%，特别是金针菇、蟹味菇种植后的废棒 。这些营养还都可以二次利用，用于诸如鸡腿菇等食用菌品种的种植 。但要注意的是，用这些废棒二次利用，最好不要超过主料总量的30%，最多不能超过主料总量的50% 。
三，用废弃的菌棒做肥料 。
废菌棒中含有很多的有机质，并经过了一个完整且时间充足的发酵过程，所以经破碎后可以直接用作肥料 。因其成分组成的特殊性，可以有效的改善土壤的团粒结构，增强土壤的透气性，是土壤改良的一种好材料 。目前，有一定数量的菌肥生产厂，采用种植废棒，经加工、再发酵、加入益生菌等技术处理，把它制作成菌肥，经实验验证效果很不错的 。
另外，有些牛羊养殖者，把菌棒粉碎，并经发酵等技术处理，把它做为饲料的填充物，并已在养殖过程中使用，据说很成功，据说对促进牛羊生长有很明显的效果 。
废菌棒的再利用，是典型的变废为宝，技能降低生产成本，又能发挥废物的作用，还能解决堆放难题，符合当前环保的大主题 。
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