“从HLPP的提出、论证再到研究工作的展开 ， 历时十余年之久 。 这是‘大科学计划’的一次意义非凡的中国实践 。 ”贺福初说 。
采访人员了解到 ， 在实施HLPP过程中 ， 中国科学家先后研究了中国人胚胎肝组织和中国成人肝脏组织的蛋白质组 ， 鉴定蛋白质超过10000种 ， 并利用这些数据对肝脏生理功能进行了系统解读 。
通过前期积累 ， 我国在蛋白质组表达谱分析的技术能力上 ， 达到国际先进水平 。 2007年 ， 蛋白质组学国家重点实验室成立 。 在2009年的国际蛋白质组标准物质评估中 ， 该重点实验室的技术能力位居全球前6 。 2018年11月 ， 蛋白质科学研究（北京）国家重大科技基础设施顺利通过国家验收 。
“有了这些积累 ， 国家科技部首次整合973计划、863计划、国际合作计划 ， 历经数年论证 ， 由蛋白质组学国家重点实验室牵头 ， 于2014年正式启动‘中国人蛋白质组计划’ 。 ”贺福初介绍 ， 2018年项目结题时 ， 已完成构建早期肝细胞癌及癌旁组织、弥漫型胃癌及癌旁组织、肠型胃癌及癌旁、肺腺癌及癌旁等疾病组织的深度覆盖蛋白质表达谱 ， 数据量达到52.7TB（万亿字节） ， 在高置信度水平上 ， 定量鉴定人类表达蛋白质15553种 ， 并获得疾病组织信号网络调控蛋白表达变化规律 ， 实现潜在分子标志物和候选靶标的深入发掘 。
“在此基础上 ， CNHPP构建了系列正常器官、组织、细胞的蛋白质组定量参考谱 。 它们相当于人体组织器官体液蛋白质的‘北斗全球定位系统’ 。 ”贺福初说 。
全面分析多种人体肿瘤蛋白质组
“‘精准’二字是医学界追求的目标 ， 即通过病因的精准诊断 ， 制定相应的精准治疗方案和预防策略 。 ”贺福初指出 。
随着“人类基因组计划”的完成、基因组测序技术的不断提升以及生物信息学与大数据科学的快速发展 ， 催生了基因组学驱动的精准医学 ， 其中最具代表性的就是2006年由美国主导的“癌症基因组图谱计划” 。 但其仍有不少局限性 。 为此 ， 美国在此基础上于2011年启动临床蛋白质组肿瘤分析项目 ， 旨在用不同种类癌症蛋白质组注释其基因组全景图 ， 创建了蛋白质组学依附于基因组学的蛋白质组—基因组学 。
“但这种蛋白质组学研究始终未能摆脱基因组学的先天不足 。 ”贺福初告诉采访人员 ， “而我们的CNHPP计划另辟蹊径 ， 对多种人体肿瘤进行了全面深入的蛋白质组分析 。 2018年 ， 我们发表了弥漫型胃癌的蛋白质组全景图 ， 建立了首个与预后相关的蛋白质组分子分型；2019年 ， 我们率先在《自然》公布了早期肝细胞癌的蛋白质组分子分型并发现新的治疗靶标 ， 开启了蛋白质组驱动的精准医学新时代；2020年 ， 我们又在《细胞》相继发表了非小细胞肺癌的蛋白质组分子分型研究 ， 再次证明了蛋白质组学在精准医学中的独特性和至关重要性 ， 为我国持续引领国际蛋白质组学研究创造了良好的条件 。 ”
采访人员了解到 ， 蛋白质组驱动的精准医学是由我国科学家首创的精准医疗新模式 ， 是一项国际多中心、多学科协作的大科学项目 ， 其实施的规模和复杂程度均远超HGP ， 对科技、经济、社会发展的推动作用也难以估量 。
贺福初说：“如果说抗生素的发明引发了第一代医学治疗技术革命 ， 影像学和分子医学的发展引发了第二代医学诊断技术革命 ， 那么 ， 由蛋白质组学驱动的精准医学 ， 势必带来精确诊断与精准治疗统一的第三代医学革命 。 ”
【蛋白质组学可更精准打击癌症】“下一步 ， ‘中国人蛋白质组计划’团队将在国际范围部署建立蛋白质组驱动的精准医学技术体系和行业标准 ， 进一步提升对重大、疑难疾病的‘精准定位’和‘精确打击’能力 。 ”贺福初透露 。
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