科学家如何利用海绵检测水生环境的eDNA?
最近有研究指出科学家可以通过检测动物定期丢到水环境中的DNA来判断水生环境中存在哪些生物 。一项新的研究表明,由于天然DNA捕获“能手”海绵,这种做法可能很快就会变得更容易 。目前,研究人员必须过滤大量的水,以便找到动物在蜕皮或排便时排出的稀释的“环境DNA”(或eDNA) 。根据英国索尔福德大学海洋生态学家Stefano Mariani的说法,这种做法涉及多项工作,而且结果可能会受到过滤设备中存在的异地DNA污染的影响 。
此外,储存的水样中的DNA可能会在处理这些样品之前降解 。考虑到这一点,他反而关注已经在海洋和淡水环境中生长的海绵 。据报道,这些生物每天可过滤多达10000升的水,并在其组织中捕获eDNA 。当Mariani和他的团队分析了在南极和地中海聚集的海绵样本时,他们发现了31个分类群的DNA。这些物种主要是鱼类,尽管来自南极洲的一个海绵样本含有威德尔海豹和帽带企鹅的DNA - 然而这主要是因为该样本聚集在企鹅繁殖地附近 。
此外,为了避免来自宿主材料的干扰,科学家利用DNA引物(一种短核酸序列)扩增脊椎动物的DNA,但对海绵本身的DNA没有影响 。“海绵是理想的采样单位,因为你可以在任何地方和每个水生栖息地找到它们,”Mariani说道 。“此外,它们不是非常有选择性的过滤器,它们不会逃跑,它们不会受到采样的伤害 - 你可以抓住一块,它们将能很好地再生 。
莱斯大学科学家采用什么方法清除剩余的超级细菌抗药性基因?
抗生素抗性细菌(或超级细菌)本身就很难被杀灭,但是即使消灭了它们,它们也可能留下抗药性基因供其他细菌使用 。现在,莱斯大学的研究人员开发了新的纳米片,可以在废水处理厂中“捕获和破坏”这些残留的基因 。细菌不仅在进行细胞分裂时会将重要的基因向下一代传递,而且还有另一种狡猾的方法可以帮助细菌快速进化 。它们实际上可以通过称为水平基因转移的过程,将基因与周围的其他细菌混合并匹配 。
这使得诸如耐药性的能力可以更快地在菌群中传播 。这也使得更难完全消除这些能力 。即使清除了一个超级细菌菌落,它们也可能留下含有抗生素抗性基因(ARG)的质粒,该质粒可被该地区未来的细菌种群所吸收 。研究人员关注的主要场所之一是废水处理厂,在这些厂中,常见的清洁方法可以杀死细菌,但不能杀死ARG 。研究人员将重点放在中国天津的一家废水处理厂上,在那里发现了一个名为NDM1的特定基因正在传播 。
“不幸的是,一些超级细菌抵抗氯化作用,并且死亡的抗性细菌释放出细胞外ARG,这些ARG在接收环境中被粘土稳定并转化为原生细菌,成为抵抗组储层,”该研究的首席研究员Pedro Alvarez说 。“这强调了技术创新的需要,以防止细胞外ARG的释放 。”作为回应,莱斯大学研究人员开发了一种技术来净化废水中潜在麻烦的环境DNA(eDNA) 。
【《长江保护法》实施一周年,edna】诀窍是使用石墨氮化碳的纳米片,这些纳米片具有旨在仅捕获eDNA的分子印记 。一旦这些基因被粘在纳米片的孔中,就可以用紫外线对其进行破坏 。为了使孔具有正确的形状,研究小组首先用甲基丙烯酸涂覆了纳米片的边缘,然后嵌入了鸟嘌呤-鸟嘌呤是DNA的四个主要碱基之一 。接下来,研究小组用盐酸将鸟嘌呤洗净,在纳米片上留下了一个完美的鸟嘌呤分子形孔 。
这就是系统中的“陷阱”部分,因为这种特定形状将捕获eDNA 。“陷阱”以紫外线形式出现 。在测试中,研究小组表示,该过程在破坏ARG方面的效率是没有分子印迹的氮化碳纳米片的37倍 。研究人员表示,该技术仍有改进的空间,但是这项概念验证研究表明,该技术可以清除废水中的残留抗药性基因 。这项研究发表在《环境科学技术》杂志上 。
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