三是纳税年度内预缴税额低于应纳税额；
四是纳税人申请退税 。
需要办理汇算清缴的纳税人 ， 应当在取得所得的次年3月1日至6月30日内 ， 向任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报 ， 并报送《个人所得税年度自行纳税申报表》 。纳税人有两处以上任职、受雇单位的 ， 选择向其中一处任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报；纳税人没有任职、受雇单位的 ， 向户籍所在地或经常居住地主管税务机关办理纳税申报 。
纳税人办理综合所得汇算清缴 ， 应当准备与收入、专项扣除、专项附加扣除、依法确定的其他扣除、捐赠、享受税收优惠等相关的资料 ， 并按规定留存备查或报送 。
新修改的个人所得税法规定 ， 扣缴义务人支付所得时 ， 应当按月或者按次代扣代缴税款,并办理全员全额扣缴申报；居民纳税人取得综合所得有扣缴义务人的 ， 由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定 ， 税务总局制发了《<个人所得税扣缴申报管理办法（试行）>的公告》（简称《公告》） 。
其中 ， 扣缴义务人 ， 也就是单位或公司 ， 向居民个人支付工资、薪金所得时 ， 按照累计预扣法计算预扣税款 ， 并按月办理扣缴申报 。累计预扣法 ， 是指扣缴义务人在一个纳税年度内预扣预缴税款时 ， 以纳税人在本单位截至本月取得工资、薪金所得累计收入减除累计免税收入、累计减除费用、累计专项扣除、累计专项附加扣除和累计依法确定的其他扣除后的余额为累计预扣预缴应纳税所得额 ， 适用个人所得税预扣率表一 。
计算累计应预扣预缴税额 ， 再减除累计减免税额和累计已预扣预缴税额 ， 其余额为本期应预扣预缴税额 。余额为负值时 ， 暂不退税 。纳税年度终了后余额仍为负值时 ， 由纳税人通过办理综合所得年度汇算清缴 ， 税款多退少补 。具体计算公式为：
本期应预扣预缴税额=（累计预扣预缴应纳税所得额×预扣率-速算扣除数)-累计减免税额-累计已预扣预缴税额
累计预扣预缴应纳税所得额=累计收入-累计免税收入-累计减除费用-累计专项扣除-累计专项附加扣除-累计依法确定的其他扣除
累计减除费用 ， 举例说明 ， 按照5000元/月乘以纳税人当年截至本月在本单位的任职受雇月份数计算 。即纳税人如果5月份入职 ， 则扣缴义务人发放5月份工资扣缴税款时 ， 减除费用按5000元计算；6月份发工资扣缴税款时 ， 减除费用按10000元计算 ， 以此类推 。
要点二：个体户和股息所得这样申报
个体工商户业主、个人独资企业投资者、合伙企业个人合伙人、承包承租经营者个人以及其他从事生产、经营活动的个人取得经营所得 ， 包括个体工商户从事生产、经营活动取得的所得 ， 个人独资企业投资人、合伙企业的个人合伙人来源于境内注册的个人独资企业、合伙企业生产、经营的所得；个人依法从事办学、医疗、咨询以及其他有偿服务活动取得的所得；个人对企业、事业单位承包经营、承租经营以及转包、转租取得的所得；个人从事其他生产、经营活动取得的所得 。
上述纳税人取得经营所得 ， 按年计算个人所得税 ， 由纳税人在月度或季度终了后15日内 ， 向经营管理所在地主管税务机关办理预缴纳税申报 ， 在取得所得的次年3月31日前 ， 向经营管理所在地主管税务机关办理汇算清缴 ， 从两处以上取得经营所得的 ， 选择向其中一处经营管理所在地主管税务机关办理年度汇总申报
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