1、首先主角从末白镇出发，获得第一个精灵（可以选择所有时代的初始精灵，然后还可以得到绿宝石时代的三只御三家） 。
2、之后进入古辰镇，古辰镇103道路找到小遥，完成剧情后开始正式的游戏 。
【口袋妖怪究极绿宝石三修复版攻略】3、进入橙华市后找到父亲，在父亲的指导下进入卡那兹市 。
4、卡那兹市有第一个道馆，战胜之后从得文总部得到去武斗镇的消息，需要去武斗镇寻找大吾 。
5、在武斗镇战胜第二个道馆，格斗道馆后得到闪光的使用能力，继而开始进入石之洞窟，找到大吾 。
6、找到大吾之后先回到卡那兹市完成剧情任务，然后从武斗镇中转到达凯那市，找到凯那市的船长，完成任务后进入紫堇市 。
7、进入紫堇市后完成电系道馆的战斗，去往绿荫镇，完成隧道任务后回到紫堇市 。
8、从紫堇市出发，可以到达秋叶镇，秋叶镇有流星瀑布任务，完成之后得到去往釜炎镇的任务 。
9、在烟囱山完成任务，经过凹凸山道，进入釜炎镇，釜炎镇完成道馆之战后遇到小遥，得到橙华市可以进行道馆战斗了 。
10、回到自己的父亲的道馆，橙华市道馆，战斗后胜利，从小光父亲手中得到冲浪，再次回到紫堇市 。
11、从紫堇市经过天气研究所，可以到达茵郁市，茵郁市有飞行道馆，战斗 。
12、之后从茂密的草丛中到达水静市，水静市有三个主要的任务，送火神山任务，火岩队基地（烟囱山上），水舰队基地任务，完成之后才可以进入下一个城市 。
13、进入下一个城市则是绿岭市，需要完成火箭发射中心和道馆之战，得到秘传机潜水 。
14、使用秘传机在水底战胜水舰队，然后出发三神兽之战，需要先到达琉璃市 。
15、在琉璃市完成觉醒神殿任务到达天空之柱唤醒裂空座，完成三神兽剧情 。
16、在琉璃市完成道馆之战，得到最后一枚徽章，得到八枚徽章之后，去往彩幽市，彩幽市有冠军之后需要通关冠军之路 。
17、之后到达最终点，进行冠军挑战赛，分别战胜四天王花月、芙蓉、波尼、源治和当前的冠军米克利，之后主角就可以成为新的冠军，第一周目就完成了 。
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