小产权房离婚时一般由双方协商分割 。因为小产权房没有完整、合法的审批建设手续，无法取得国家认可的房屋产权证，所以不能在离婚时要求法院分割处理 。只能双方私下处理 。
《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理;协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决 。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护 。
小产权房购买风险1、法律风险 。
因为小产权房只具备普通商品房的使用性质，而不具备普通商品房的法律性质 。所以，法律法规对商品房的相关规定和制度不适用小产权房，人民法院也就不能适用商品房买卖的法律规定及司法解释处理涉及小产权房的案件，购房人的权益很难得到有效维护 。
【小产权房离婚时如何分割】2、政策风险 。
若购买的是在建小产权房，购房人与开发商签订合同并交付房款后，如果相关部门整顿小产权房的建设项目，可能就会导致部分项目停建甚至被强迫拆除 。那么只能是购房人找开发商索要购房款，购房人就可能面临既无法取得房屋，又不能及时索回房款的尴尬境地 。另外，购房后如果遇到国家征地拆迁，购房人并非合法的产权人，所以其很可能无法得到对产权进行的拆迁补偿 。
3、转让风险 。
根据《中华人民共和国土地管理法》的规定，农民集体所有的土地的使用权不得出让、转让或者出租用于非农业建设 。而农村宅基地属集体所有，村民对宅基地也只有享有使用权，农民将房屋卖给城市居民的买卖行为不能受到法律的认可与保护，也就不能办理土地使用证、房产证、契税证等合法手续 。由此可见，小产权房若向非本集体成员的第三人转让或出售，因不能合法转让过户 。其同时对房屋的保值和升值有很大影响 。
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