鸭蛋的脂肪含量比鸡蛋高一些，这可能是因为它们的伙食不太一样，鸭子偶尔在河里边吃一些小鱼小虾之类的，营养含量比鸡吃的小虫子高，而咸蛋就是要脂肪含量高，而且鸭蛋黄里色素中的叶红素含量也高 。制成咸蛋后，蛋白软嫩，蛋黄中的油分积聚，色泽诱人，松沙可口，比咸鸡蛋的油分更多更好吃，这样味道更加醇香，口感也更加细腻，不能出油的咸蛋黄是没有灵魂的 。因此，用鸭蛋腌制咸蛋是最适宜的 。
中医也说，鸭蛋腌制吃滋阴清火，咸鸭蛋有一些的微苦，性凉，有滋阴、清肺、丰肌、泽肤、除热等功效 。中医认为，咸鸭蛋清肺火降肝火的功效比鸡蛋显著，因此即使把它做成了咸蛋，还是不至于太过上火 。鸭蛋本就是性凉之物，而腌制物往往是上火的 。这两种东西一中和，但是达到了意想不到的效果 。
在以前的农业时代，腌制食物有很强的地域性和季节性，鸡的养殖全国各地都有，而鸭子适应于养殖在一些水域分布密集的地方，也就是南方，北方基本很少见大型的养殖场，这样一来，鸭蛋在特定季节的特定地区会突然暴涨，人们只好用腌制的办法来进行保存 。这也就产生了美味可口的咸鸭蛋 。
【为什么咸鸭蛋比咸鸡蛋好吃】其实现在不少地方还是有很多咸鸡蛋的，只是咸鸭蛋已经在人们的心中形成了一种主流，这种意识已经难以改变了，所以很多人还是会选择用鸭蛋来腌制而不是鸡蛋 。
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